Depois de ser derrotado no tempo normal por 2×0, o time do Regatas São João superou o Nako/Cruzeirinho nos penais por 5×4, e conquistou na manhã de domingo, dia 12 de junho, o título de campeão da Segunda Divisão do Campeonato Amador de São João da Boa Vista 2016.
No domingo, dia 19, ocorrerá a super decisão da 1ª Divisão entre SES-Esportiva e Pratinha. Na primeira partida da final, a Esportiva venceu por 2×0